Pourrain, de son nom antique "pulverenus", compte un nombre important de hameaux (45). Le village est situé sur une longue colline qui domine trois vallées : la vallée de Baulches, le Ru de Varenne et la vallée du Tholon. De son point culminant aux Chailloux (293 m), il jouit d'une vue exceptionnelle. Sa superficie est de 2384 ha.
Possession de Saint Germain au Ve siècle, puis des évêques d'Auxerre, il fut érigé en paroisse dès le VIe siècle. A partir de 820, il releva du Chapitre "Cathédrale", et ce jusqu'à la Révolution. C'est en 1304 que les habitants reçurent, des chanoines, une charte d'affranchissement. Fin Xe, début XIIe siècle, une église de pierre fut construite sur le promontoire du bourg. Elle conserva sa nef romane jusqu'au milieu du XIXe siècle ; un beau choeur Renaissance domine, de ses hautes verrières, la rue en contrebas. C'est également à l'époque Renaissance que fut construite et décorée la chapelle Saint-Baudel. Napoléon de retour de l'île d'Elbe passa par Pourrain et la portion de route qu'il emprunta porte aujourd'hui son nom : route impériale (RD 965). En 1429, Jeanne d'Arc traversa également Pourrain en se rendant à Chinon, comme elle traversa nombre de villages de Puisaye. Fin XVIIIe, début XIXe siècle, Pourrain exploita ses carrières d'ocre. Mais en 1835, sa production fut concurrencée par les ocres de Sauilly (Diges), de meilleure qualité. Les sites fermèrent au début de la Seconde Guerre Mondiale et Pourrain perdit la moitié de ses habitants. Maintenant, Pourrain est une bourgade active, favorisée par la proximité d'Auxerre, elle compte de nombreuses associations. Sa population totale légale au 1er janvier 2009 est de 1416 habitants, (sa population municipale est de 1369 habitants) répartis dans le bourg et les 45 hameaux ou lieux-dits habités.