D'une population de 1 751 habitants sur 973 hectares, la situation géographique est assez particulière car la commune de Fontenay-sur-Loing s'étend sur 8 km de long et sur 1,5 km au plus large. C'est un peu le Chili du Gâtinais.
Ses limites sont la rivière de la Cléry au Nord, le Loing à l'Ouest, la forêt de Montargis au Sud et des chemins vicinaux à l'Est.
Elle est traversée du nord au sud par la route Départementale 2007 (ex Nationale 7) gérée par le Conseil Général du Loiret.
La ligne de chemin de fer Paris - Nevers traverse elle aussi la commune dans toute sa longueur, ainsi que le canal du Loing.
L'autoroute A 19 a fait son apparition dans le paysage de la commune avec son ouverture le 16 juin 2009. L'échangeur avec la RD 2007 permet des déplacements vers l'Est ou l'Ouest de la France beaucoup plus rapides et sécurisés.
Fontenay-sur-Loing fait partie du canton de Courtenay qui comprend 19 communes. Celles-ci sont regroupées au sein de la CC4V, Communauté de Communes des 4 Vallées.
Fontenay doit son nom au nom latin "fons" "fontis", qui veut dire "la source", qui deviendra Fontenoy au fil du temps et enfin Fontenay, grâce à la source St Victorin encore présente sur le territoire, qui guérissait les fièvres, l'enflure, la langueur et que l'on disait spécifique pour faire disparaître la gravelle et la pierre (calculs rénaux).
Avec l'arrivée du chemin de fer en 1860, la topographie du village a été bouleversée. L'église, au milieu du cimetière, était située sur le tracé de la ligne SNCF et a été démolie sans modifier le cours de la source, qui donne toujours naissance à un petit ru, alimentant le moulin du bourg avant de se jeter dans le Loing.