L'église (bâtiment actuel) est plus romaine que gothique et a été construite en deux campagnes.
En 1165, il servit de refuge à 80 moines de Vézelay, lors des menées et voies de fait du comte de Nevers. Le nom de Pont Loup (pont sur la Loue = Loing) apparaît en 1175.
Situés hors des murs de Moret, ses bâtiments furent en partie détruits au cours des guerres du XVIe siècle.
En avril 1747, l'archevêque de Sens en prononce la suppression. En avril 1791, ce qui subsiste des bâtiments est vendu comme bien national.
Pendant tout le XIXe siècle, l'église a servi de grange à écorce pour les moulins à tan.
En 1964, elle est devenue propriété de la ville de Moret-sur-Loing qui en commence la restauration... Aujourd'hui c'est un lieu de rencontres artistiques.
Ouverture : Les vendredis, samedis, dimanches et jours fériés, de 14h à 18h (mars-avril et septembre-décembre), de 14h à 19h (mai-août).